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BLOSUM打分矩阵是一种在生物信息学中用于序列对比的氨基酸替换打分矩阵。BLOSUM 是“blocks substitution matrix”的缩写。它是目前常用的一种氨基酸替换打分矩阵。BLOSUM打分矩阵最早由 Steven Henikoff. 和 J.G Henikoff在他们的论文中被提出。其中,他们从BLOCKS数据库中对那些在高度保守序列中的蛋白质家族进行观察测量进而整理出了氨基酸替换的概率。他们继续使用对数胜算来计算矩阵中的分值。与PAM打分矩阵相比,BLOSUM打分矩阵的内容皆由观察得出。在实际运用中,BLOSUM矩阵通常能获得更好的结果。
目前最常使用的BLOSUM62矩阵被发现存在计算错误。然而这些计算错误却使该矩阵在序列对比时的表现提高了
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动物考古学是一门将考古学和动物学研究结合在一起的“综合性”学科,这两者分别研究过去的人类文化和动物,因此,动物考古学家也可能是人类学家、古生物学家、考古学家、动物学家或生态学家等。但是,动物考古学的主要重点不仅在于发现过去动物的遗迹,更要识别和了解人类及其环境(主要是动物种群)如何共存。动物考古学可使研究人员更全面地了解过去人与环境的相互作用,从而使该主题成为环境考古学的一部分。无论是饮食、驯化、工具使用还是礼仪活动,对动物遗骸的研究提供了大量与其互动的人类活动信息。考古学提供了有关过去的信息,这些信息对理解现在和应对未来都极其宝贵。动物考古学在促进对动物本身、相邻人群和当地环境的全面了解方面发挥着重要作用。
北美东部动物考古学的发展可分为三个不同的时期,第一阶段是19世纪60年代左右开始的形成期;第二阶段是20世纪50年代初出现的系统化期;最后是1969年左右形成的整合期。直到系统化时期,专业动物考古学家才出现。在此之前,它只是一种应用技术而没有专门的研究。
动物考古学专家出现的部分原因是产生了一种被称为过程考古学的考古学新方法,该方法更强调解释事情发生的原因,而不仅仅在于发生了什么。考古学家开始专攻动物考古学,他们的人数也在增加。
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郑德坤出生于厦门鼓浪屿,早年就读于其父亲任教的英华书院。1930年获燕京大学文学士学位。次年攻读研究生,师从顾颉刚、洪业等。1931年获硕士学位,留任哈佛燕京学社研究员。此后曾任教于厦门大学、华西协合大学。1938年赴美国哈佛大学留学,专攻考古学与博物馆管理。1941年获博士学位后返国,任教于华西协合大学并出任校博物馆馆长。1948年移居香港。1951年至1974年间,赴英国剑桥大学任教。后回到香港,任香港中文大学文学院院长、副校长。1978年创办香港中文大学中国考古艺术研究中心。
郑德坤的研究涉及考古学、历史学、人类学、艺术史等诸多领域,著有《水经注引得》(1933年)、《四川古代文化史》(1946年)、《四川考古研究》(1957年)、《史前中国》(1959年)、《商代中国》(1961年)、《周代中国》(1963年)、《史前中国的曙光》(1966年)、《中国艺术和考古导论》(1973年)、《沙捞越考古》(1969年)、《中华民族文化史论》(1978年)、《中国考古学研究》(1982年)、《中国陶瓷研究》(1984年)等中英文学术著作。
2001年4月6日,郑德坤在香港去世,终年93岁。
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