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* 永历(1647年-1683年):南明—永历帝朱由榔、明郑之年号
* 阳德(1672年-1674年):后黎朝—嘉宗黎维禬之年号
* 宽文(1661年-1673年):后西天皇、灵元天皇之年号
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潘珍,字玉卿,初号朴庵,又号莪峰、两峰,晚号碧峰,直隶徽州府婺源县(今江西婺源县)人,明朝政治人物。
弘治十五年(1502年)登进士,授浙江诸暨县知县,后任大理寺左评事、左寺副、署大理寺左寺正。正德六年(1511年)任山东按察司佥事。正德十一年(1516年)任山东按察司副使、福建按察司副使。嘉靖二年(1523年)任山东按察使。改湖广右、左布政使。嘉靖七年(1538年)任都察院右副都御史、巡抚辽东。嘉靖十一年(1542年)任南京都察院右副都御史、提督操江。嘉靖十二年(1543年)任南京兵部右侍郎。嘉靖十五年(1546年)任兵部右侍郎,改兵部左侍郎。因反对征讨安南,而免职归乡。嘉靖二十七年卒,享年七十二,赠都察院右都御史。
著有《愚衷录》、《省愆录》、《两峰存稿》、《年纪》。
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蛋白质结构预测方法在预测具有低接触序的蛋白质结构方面更准确。这可能部分是因为低接触序的蛋白质往往很小,但可能是由于在最小化能量函数的全局优化过程中要考虑的可能的远程残基-残基相互作用的数量较少。与在实验确定的蛋白质结构中观察到的分布相比,即使是Rosetta方法等成功的结构预测方法也会过度产生低接触阶结构预测。
原生折叠接触序的百分比也可用作折叠过渡状态“原生性”的量度。结合分子动力学的Phi 值分析产生了过渡态模型,其接触序接近于小且快速折叠的蛋白质中的折叠状态。此外,过渡状态下的接触序以及原始状态下的接触序与整体折叠时间高度相关。
除了它们在结构预测中的作用外,还可以根据序列比对接触序本身进行预测,这可用于对与已知序列具有某种程度同源性的新序列的折叠进行分类。
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