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染色质免疫沉淀-测序(ChIP-sequencing,简称为ChIP-seq)被用于分析蛋白质与DNA的交互作用。该技术将染色质免疫沉淀(ChIP)与大规模并行DNA测序结合起来以鉴定与DNA相关蛋白的结合部位。其可被用于精确绘制任意目的蛋白在全基因组上的结合位点。在此之前,ChIP-on-chip是研究这些蛋白-DNA联系的最常用的技术。
ChIP-seq主要用于确定转录因子和其他染色质相关蛋白质如何影响表型影响机制。确定蛋白质如何与DNA相互作用来调控基因表达对于充分了解许多生物过程和疾病状态至关重要。这种表观遗传信息与基因型和表达分析是互补的。 ChIP-seq技术目前主要被看作是需要杂交阵列的ChIP-on-Chip的替代品。 这必然会引入一些偏差,因为一个阵列仅限于有固定数量的探针。相反,尽管不同测序技术的测序偏差尚未完全了解,测序被认为偏差较小。
与转录因子和其他蛋白质直接物理相互作用的特定DNA位点可通过染色质免疫沉淀被分离出来。 ChIP产生在活体内In vivo兴趣蛋白质结合的目标DNA位点文库。 大规模平行序列分析与全基因组序列数据库结合使用来分析任何蛋白质与DNA的相互作用模式或任何表观遗传染色质修饰的模式。 这可以应用于一系列ChIP蛋白和修饰,如转录因子,聚合酶和转录机制,结构蛋白质,蛋白修饰和DNA修饰。 作为对特异性抗体依赖性的替代方法,已经开发了不同的方法来发现基因组中所有核小体耗尽的(nucleosome-depleted)或核小体扰动(nucleosome-disrupted)的活性调控区的超集,如DNase-Seq和FAIRE-Seq。
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增祺(1919年),字瑞堂,伊拉里氏,满洲镶白旗人,为中国清朝官员。
初为密云驻防,以佐领调黑龙江,佐练兵事,历至齐齐哈尔副都统。光绪二十年(1894年),署将军。光绪二十四(1898年)年,擢福州将军,充船政大臣,兼署闽浙总督。同年,任盛京将军。光绪二十六年(1900年)俄国除参与八国联军对华作战外,还调集十几万军队,以保护东清铁路为名,并借口増祺支持义和团闹事,大举入侵中国东北地区。俄军攻陷奉天省(今辽宁省),一度将増祺关押于民居中。增祺在其胁迫下,派代表周冕与俄国代表签订《奉天交地暂且章程》九条,规定俄军驻防奉天等处,该省清军一律解散,将军要听命于俄方“总管”。但清政府拒绝批准,并将增祺革职。旋仍留任。1903年10月28日,本来已经按照条约撤退的俄军士兵千余人回到奉天,再次拘押増祺。光绪三十一年(1905年),丁忧免职。任内曾招安张作霖,并任其为游击马队管带。光绪三十三年(1907年),授宁夏将军。
宣统元年(1909年)迁广州将军。1910年10月29日-1911年4月14日期间,奉旨接替袁树勋署理两广总督。全名为「总督两广等处地方提督军务、粮𫗵兼巡抚事」的该官职,是兼辖广西地区的广东、广西两省之最高统治者,亦为清朝封疆大吏之一。
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