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蝙蝠冠状病毒Rp3(Bat SARS-CoV/Rp3/2004)是严重急性呼吸系统综合症相关冠状病毒(SARSr-CoV)的一个病毒株,为SARS-CoV相关病毒,在中国广西的皮氏菊头蝠样本中发现,于2005年发表。
2004年3月至11月,研究人员在中国广东、天津、广西与湖北四省市采集蝙蝠样本,在广西南宁皮氏菊头蝠的粪便样本中发现SARS相关病毒,即Rp3病毒,于2005年和Rf1病毒与Rm1病毒一起发表。
Rp3病毒的基因组长29736nt,序列与SARS-CoV的相似度为92.6%,其ORF8和人类以外的大多数SARSr-CoV一样有一段长29nt的插入序列,为一完整的开放阅读框,人类的ORF8则因缺少此序列而被分成8a与8b两个较小的开放阅读框。Rp3的ORF8(121个胺基酸)比人类SARS病毒ORF8辅助蛋白(121个胺基酸)少一个胺基酸,且两者胺基酸序列相似度仅35%。另外Rp3与许多蝙蝠SARSr-CoV一样在刺突蛋白的受体结合结构域(receptor binding domain, RBD)有两段分别长5和12个胺基酸的序列缺失(但不见于WIV1病毒与SHC014病毒)。
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