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林汉明一家六口早年在九龙慈云山的徙置区慈云山邨成长，母亲为一名车衣女工。他曾就读圣公会约荣小学（1973年第4届上午校毕业）。作为基层家庭的长子，林汉明被告知自己或需要成为学徒帮补家计；能够升读中学的条件是中学学费为父母可负担的范围之内。于是林汉明向小学老师租借新旧补充练习，每天清早起身操练，于1973年以考取的政府奖学金升读伊利沙伯中学。当年全港应届小学毕业生中，包括林汉明在内共有141名获豁免中学学费。但在校时因花太多时间参与排球校队的运动，结果成绩一落千丈。其中在就读中四时，他的成绩在40名学生当中排名倒数第四，英文科、地理科和生物科均不及格。他之后发奋读书，在1978年香港中学会考公开试中考获 2A（物理、化学）2B（生物、数学）的优异成绩。林汉明后来又因自满而再次沉迷排球活动，最终未能考上大学。唯有在1981年以自修方式考进香港中文大学。曾是大学学生会的成员。

自1985年大学生物学学士毕业后，林汉明远赴美国西北大学修读生物学博士学位。他曾于1992年至1996年期间在纽约大学研究氮的代谢过程，令他于植物分子生物学领域建立了名声，并且获全球最大种子供应商、跨国农业生物技术公司孟山都（Monsanto）邀请加盟旗下。然而林汉明婉拒了公司的邀请，在1997年回流香港且于翌年开始在香港中文大学进行大豆研究。研究大豆的工作并非其专长。他受到中国农业科学院研究员邵桂花的启发，与研究团体成功在2010年，以分子标记的技术完成17种野生大豆和14种人工培植大豆的基因序列。四年后，林汉明的科学研究工作出现突破；辨识出大豆的抗盐基因。他其后与中国甘肃省农业科学院一同培育出全新的抗逆大豆品种「陇黄1号」、「陇黄2号」以及「陇黄3号」。三种大豆都获得政府正式审批。

林汉明有关研究大豆的论文于2010年登上西方著名的学术期刊《自然遗传》（Nature Genetics）的封面。该封面文章的内容围绕深圳华大基因研究院与其研究项目「大豆回家」的成果─破解了31种野生大豆及人工培植大豆的全基因组密码和说明了野生大豆与人工培植大豆相较具有更强的耐逆力和生命力。在2013年，他与辛世文教授等人在国际知名的医学期刊《刺针》（The Lancet）中发表综合论述，探讨并且总结中国所面对的粮食及食品安全问题。而林汉明有关野生大豆耐盐的基因研究论文亦于2014刊登于《自然通讯》（Nature Communications）中

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