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这一方法经常出现在凝聚态物理学中，生成与实验数据相对应的原子结构模型或是某种限制条件下的物态。
初始的结构是周期性边界条件下N个原子组成的晶胞。基于这一构型可计算一个或一个以上的可测量参数。常用的可测量参数包括对分布函数及其傅里叶变换形式，后者可由中子或x射线衍射直接获得实验数值。其余还有晶体材料的布拉格衍射参数和扩展x射线吸收精细结构参数。实验值与模拟值的比较由以下函数形式量化
其中yobs和ycalc分别为观测值（实验值）和计算值（模拟值）， σ是测量精度。
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始祖鸟科（学名：Archaeopterygidae）是生活于侏罗纪的一科非鸟恐龙。其下包含了最为知名的始祖鸟。始祖鸟科与早期鸟类不同的是其长及骨质的尾巴，一些物种甚至有较长的第二趾。
始祖鸟科属于独有的始祖鸟目，最初其下只有始祖鸟一属。当未有任何种系发生学的定义时，始祖鸟科是一个包含了所有接近始祖鸟而又疏于新鸟亚纲鸟类的分支。
驰龙科传统上被认为是非鸟类的恐龙，也被分类到始祖鸟目中。后来发现的一些原始形态令早期鸟类的关系变得模糊，使伶盗龙及相似的恐龙都有可能是鸟类之一。葛瑞格利·保罗（Gregory S. Paul）将驰龙类分类到始祖鸟目中，但大部份支序分类学的研究都认为牠们是在鸟纲之外。
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