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杜鹃花科植物的是浅根性植物,根系分布很浅,根部没有根毛但有极细的hair root能让杜鹃花菌根共生,菌根疏松的包附在根部的表皮细胞上后穿入皮层并在细胞间产生菌丝圈来将细胞紧紧包附,且通常只包裹住单个细胞,但并不穿入细胞膜。菌丝圈通常只能持续几周,不久后便会崩坏分解。
菌丝圈是真菌和植物用来交换养分的场所,菌根提供来自土壤的养分而植物提供光合作用的糖类。杜鹃花菌根具有产生酵素来分解复杂有机物的能力,这让一些菌根具有腐生能力,能取得有机上的营养,例如氮,这些矿物元素在杜鹃花科植物生长的环境是十分缺乏的。
目前对杜鹃花菌根主要的生理功能研究在于Rhizoscyphus ericae所分离下来的型态鉴定,Rhizoscyphus ericae原属于囊菌刚的柔膜菌目,但现在归类在Pezoloma 。除了Rhizoscyphus ericae外,目前可以培养子囊菌类的杜鹃花菌根有Meliniomyces (似Rhizoscyphus ericae), Cairneyella variabilis, Gamarada debralockiae和Oidiodendron maius 。DNA定序分析揭露了杜鹃花根系的真菌族群多样性,但有可能包含其他非菌根真菌、腐生菌或寄生菌。
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