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隐真菌与真菌演化另一个早期的分支微孢子虫的关系尚未有定论，但许多研究显示这两群生物的关系相当接近，许多原本认为是微孢子虫特有的基因，例如从宿主细胞质中抢夺ATP的通道蛋白，意外地在隐真菌基因组中被发现，分析结果显示两者与另一种所知甚少的藻类寄生物Aphelids共同形成一支序（ARM群，或被称为Opisthosporidia）。随后有一群以变形虫为宿主的微生物Paramicrosporidium被发现也属于隐真菌，且它们的型态与微孢子虫非常相似，但rDNA序列与隐真菌较为接近，被认为可能是隐真菌与微孢子虫演化上的过渡，在此假说中，微孢子虫是ARM群中较为特化的类群，特化出专门用来感染动物细胞的结构，隐真菌与Aphelids则无此结构。2014年，另一种以变形虫、藻类为宿主的微生物Nucleophaga也因DNA序列分析被归为隐真菌，且型态介于罗兹菌与Paramicrosporidium之间。
2018年，Tedersoo等人提出的支序分析研究主张隐真菌与微孢子虫共同构成真菌分类的基群，其中微孢子虫属于隐真菌门中一个较深的支序，因此将微孢子虫的分类地位由独立的门降至隐真菌门的一个纲。另外原本认为与隐真菌关系密切的Aphelids则可能与壶菌亲缘较为接近，而另独立成一个门（Aphelida）。
隐真菌门早期的描述是寄生于宿主细胞表面、缺乏细胞壁、形态类似壶菌的生物，Rozella的型态与胞内寄生的生活史都非典型，但此一分类法有不少缺点，其字源「隐藏」之意指这类生物长期被研究者忽略，直到分子序列分析兴起后才揭开神秘的面纱，但这项特征适用于许多其他真核生物，并非隐真菌的专利，至于罗兹菌属是否具有代表性也有可讨论的空间，因为对隐真菌生活史的了解仍少，不清楚是否多数物种可以同时具有细胞表面寄生与胞内寄生两种生活型态，因此罗兹菌的型态与生活史未必非典型。
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刘小乐（Xiaole Shirley Liu），生物信息学家，现为哈佛大学生物统计与计算生物学系教授，主要研究领域包括计算生物学、表观遗传学与癌症生物学等。
刘小乐早年曾就读于天津南开中学，1992年考入北京大学生物系。1994年转学至美国，进入史密斯学院学习，1997年获生物化学与计算机科学双学士学位。后进入斯坦福大学深造，2002年获生物医学信息学博士与计算机科学辅修博士学位。此后任教于哈佛大学，为哈佛公共卫生学院与丹娜法伯癌症研究所（Dana-Farber Cancer Institute）生物统计与计算生物学系教授，并担任丹娜法伯癌症研究所功能性癌症表观遗传学中心主任。harvard
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10A01型列车共246辆，共41组，由上海电气和南京浦镇车辆厂负责生产，2009年9月13日，首列列车抵达上海。在2010年开始使用，目前在10号线运营，编号为1001-1041。其中上海电气负责生产编号为双数的列车，南京浦镇车辆厂负责生产编号为单数的列车。列车客室车门为外置滑轨门，车身外涂装为淡紫色和白色。列车配属于吴中路停车场。
列车在2014年8月实现无人驾驶，驾驶室窗和两侧隔板（可拆卸）上均有可观看司机室和前方隧道的大幅玻璃。初期玻璃均被黑纸封上，无法观看。2022年，所有车辆的驾驶室旁板已被拆除，乘客可以直接在车头观景。
2011年9月27日14时51分，10号线豫园至老西门下行区间内1005号列车与1016号列车发生追尾事故，共295人前往医院治疗。事故造成虹桥路站至天潼路站9站路段封站，其余两端采取小交路方式保持运营。9月28日首班车至20时，10号线伊犁路站至四川北路站停运。
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