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分子生态学中可以使用很多基因进行研究，在分类学角度，最常应用的基因是核糖体小亚基RNA(SSU rRNA)。而功能性基因的研究有助于判断微生物在该环境中的活动。
微生物生态学中和分子技术相关的一个重要问题就是，这些生物以主动（进行正常代谢和繁殖）还是被动（静息休眠）的方式存在。这可以用几种方式来解决：
* 用荧光原位杂交(FISH)对环境中包含特定基因的细胞进行检测和计数。
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* 美国职棒加州天使队（小联盟～小联盟，1990年～1991年）
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口北三厅，是清朝直隶省（今河北省）北境的一个并称地名，泛指当时直隶省所管辖的多伦诺尔厅（今内蒙古自治区多伦县）、独石口厅（今河北省沽源县南境)、张家口厅（今河北省张家口市市区）等三个直隶厅之地，多在当时宣化府之外的北境。亦即，口北三厅此地，是介于今河北北部长城内外和内蒙古锡林郭勒盟南部的农牧交错地带的三个直隶厅级行政区划的总称。
这三个厅，皆是在雍正皇帝年间设立，雍正二年（1724年）置张家口厅，十年置多伦诺尔厅，十二年置独石口厅，并与直隶省宣化府，同属于直隶省管辖的口北道。到了乾隆二十三年，有金志章、黄可润等人，陆续为这三个直隶厅，修成并出版了一本《口北三厅志》，为记录当地的一本清代地方方志。
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