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更新于 2026-10-24

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在计算生物学中,N50和L50是Contigs(重叠群)或脚手架长度的统计值。N50的计算方式类似于平均值或中位数,但是对长Contigs的权重更大。这种方法广泛运用于序列组装中,特别是在参考组装草稿内的Contigs长度中。这种度量常被用来描述基因组装配(有时还有其他装配)的“完整性”。但它的本质是告诉你一些关于Contigs长度分布的信息。

N50根据连续性定义装配质量。按照序列长度的顺序排列你的集合中的所有Contigs。首先是最长的Contigs,然后是第二长的Contigs,最后是最短的Contigs。然后,从一开始累加所有Contigs的长度,这样您就可以得到最长的Contigs+第二长的Contigs+第三长的Contigs,以此类推,直到达到占总装配长度50%的数字,即为N50。N50可以近似的看作分布质量一半的点:比N50长的所有Contigs的碱基数于比N50短的所有Contigs的碱基数在数值上是接近的。

L50定义为,在给定一组Contigs的情况下,长度总和占基因组大小一半的最小Contigs数。

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相关阅读:N50、L50和相关统计学

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小短趾百灵(学名:Calandrella rufescens),是百灵科短趾百灵属的一种,是全面迁徙的候鸟,分布于巴基斯坦领土、塞尔维亚、埃及、利比亚、以色列、土库曼斯坦、西班牙、土耳其、保加利亚、挪威、直布罗陀、阿曼、突尼斯、卡塔尔、中国大陆、毛里塔尼亚、奥地利、乌兹别克斯坦、德国、芬兰、罗马尼亚、沙特阿拉伯、阿拉伯联合酋长国、约旦、黑山、乌克兰、瑞典、巴基斯坦、俄罗斯、塞浦路斯、黎巴嫩、阿塞拜疆、格鲁吉亚、英国、亚美尼亚、摩洛哥、伊朗、爱尔兰、哈萨克斯坦、希腊、阿富汗、科威特、塔吉克斯坦、吉尔吉斯斯坦、阿尔及利亚、荷兰、叙利亚、瑞士、巴林、马耳他、伊拉克、葡萄牙、意大利和西撒哈拉。该物种的保护状况被评为无危。

小短趾百灵的平均体重约为25.2克。栖息地包括温带草原、温带疏灌丛、亚热带或热带的(低地)干燥疏灌丛和盐沼。

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