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蛋白质结构预测方法在预测具有低接触序的蛋白质结构方面更准确。这可能部分是因为低接触序的蛋白质往往很小,但可能是由于在最小化能量函数的全局优化过程中要考虑的可能的远程残基-残基相互作用的数量较少。与在实验确定的蛋白质结构中观察到的分布相比,即使是Rosetta方法等成功的结构预测方法也会过度产生低接触阶结构预测。
原生折叠接触序的百分比也可用作折叠过渡状态“原生性”的量度。结合分子动力学的Phi 值分析产生了过渡态模型,其接触序接近于小且快速折叠的蛋白质中的折叠状态。此外,过渡状态下的接触序以及原始状态下的接触序与整体折叠时间高度相关。
除了它们在结构预测中的作用外,还可以根据序列比对接触序本身进行预测,这可用于对与已知序列具有某种程度同源性的新序列的折叠进行分类。
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西钻光鱼(学名:Gonostoma atlanticus)为辐鳍鱼纲巨口鱼目钻光鱼科的其中一种。
本鱼背面深色, 体侧面为银色,鳍条无色,在每个背鳍与臀鳍鳍条的基底的黑色素,细长侧扁。皮肤裸露无鳞。头小,吻短而钝尖。眼小而圆,近吻端,其眼间隔约与眼径相等。口大,斜裂,上颌后端明显超过眼眶后缘。无脂鳍,背鳍软条16至18枚;臀鳍软条26至31枚,体长可达6.6公分。
本鱼属深海鱼类,具垂直性洄游的特性,属肉食性,利用其发光器官吸引猎物,以磷虾及桡脚类为食,产浮游性卵。
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他试图诉诸理性的方法,证实上帝的存在和属性,并在柏拉图的观念论及奥古斯丁对神的理解中,找到论述材料。柏拉图称普遍观念,不只在人的思想中存在,并且在现实世界中也具有实质之存在,即是实名论(Realism)。也就是说,在我们自己的思想里,原本就具有一个绝对完美的实体概念,而这个「完美的」所包含的就是存在,所以神存在 。再就「上帝」这字的本身,这个名的本质,就包括了存在。因此,神存在于我们的观念中,也存在于实体中。
在《宣讲》(Proslogion)中,安瑟莫仅仅藉「神」的概念,就证明神的存在,并提出本体论的重要内涵:「我们不能够想像得比它更大的东西,他就存在。」《宣讲》第二章。
所谓的上帝就是「无法设想比它更伟大或更完美的那一位存在者」,这是安瑟莫本体论证的逻辑前提。上帝是一切存有的原因,但祂自己却不以任何他物为其原因,祂是「凭自身」而存在。即当本质上是最真、善、美的时候,那就是存在;当存在和本质相同的时候,那就是上帝。但若「最完美者」仅存于意识,而不存见于现实时,便不是最完美之存在。因为它还可以让人思想一个更完全,且兼具观念之存在与现实的存在者。因此,最完全者之概念不但具有思想上之实在,且须具有绝对之实在。
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