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2001 年首度发现 RNA 降解体的位置是位于细菌内膜，2004 年与国际团队共同发现 RNA 降解在基因表达过程中的功能。

同时也研究细菌中的非编码小 RNA（non-coding small RNA），发现细菌会利用其调控防御病毒感染和引发疾病，并研究这些小 RNA 的裁切与降解。

林淑端长期以大肠杆菌这种常见于人体肠道内的细菌为模型，进一步从肠道的无氧环境中，观察细菌如何透过 RNA 降解体调控生存能力并适应环境。2017 年发表的研究即是指出细菌在无氧环境中转变并存活的过程，也首度揭露大肠杆菌中含有糖酵解烯醇酶（glycolysis enolase）的原因。

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安德洛尼卡一世是特拉比松开国皇帝阿历克塞一世的女婿。当阿历克塞一世于1222年去世后，安德洛尼卡一世夺得了皇位。同年，塞尔柱突厥人出兵围攻特拉比松。但最终塞尔柱人兵败，其君主被俘。安德洛尼卡一世与塞尔柱人达成协议，特拉比松不再臣服于塞尔柱人的罗姆苏丹国。

不过特拉比松的独立并没有维持很久。由于安德洛尼卡一世与花剌子模苏丹札兰丁联合同罗姆苏丹国开战，双方原先的和约作废。最终，罗姆苏丹国获胜，特拉比松帝国于1230年再次成为罗姆苏丹国的附属国。

安德洛尼卡一世于1235年去世，其死后阿历克塞一世之子约翰一世继承了皇位。

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11世纪后，有一支藤原秀乡的子孙以蒲生郡为据点开始发展，成为蒲生氏，并建立日野城，同时北部区域则有近江守护六角氏所建的观音寺城；蒲生氏后来成为六角氏的部属，16世纪末织田信长消灭六角氏后蒲生氏改臣服于织田信长，并继续领有日野城。

1576年织田信长在郡内的安土山兴建安土城作为其居城，但在1582年本能寺之变后遭到焚毁，1585年取代织田信长的丰臣秀吉将本地封给丰臣秀次，并在八幡山兴建八幡山城，1590年改由京极高次接替，但在1595年由于丰臣秀次遭到丰臣秀吉所杀，八幡山城受带连带影响遭到废除。

在江户时代大部分区域为幕府直属及旗本，另有部分区域分属郡山藩、仁正寺藩、川越藩、仙台藩、水口藩、尾张藩、淀藩、宫津藩、近江宫川藩、山上藩、前桥藩、丸龟藩、伯太藩、峰山藩，其中也有属于门迹、公家、寺社的领地，而此地的幕府直属领及旗本领则是由位于滋贺郡大津的大津奉行负责管理。

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